|
Bacteroides coprocola M16 DSM 17136 |
n.a. |
n.a. |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Bacteroides coprophilus DSM 18228 |
n.a. |
n.a. |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Bacteroides dorei CL02T00C15 |
n.a. |
n.a. |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Bacteroides dorei CL02T12C06 |
n.a. |
n.a. |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Bacteroides dorei CL03T12C01 |
n.a. |
n.a. |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Bacteroides massiliensis B84634 |
n.a. |
n.a. |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Bacteroides plebeius M12 DSM 17135 |
n.a. |
n.a. |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Bacteroides salanitronis DSM 18170 |
n.a. |
n.a. |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Bacteroides vulgatus CL09T03C04 |
n.a. |
n.a. |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Bacteroides vulgatus dnLKV7 |
n.a. |
n.a. |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Bacteroides vulgatus PC510 |
n.a. |
n.a. |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Bacteroides dorei DSM 17855 |
n.a. |
n.a. |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Clostridium citroniae WAL 17108 |
n.a. |
n.a. |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Clostridium clostridioforme 2 1 49FAA |
n.a. |
n.a. |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Clostridium clostridioforme 90A1 |
n.a. |
n.a. |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Clostridium clostridioforme 90A3 |
n.a. |
n.a. |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Clostridium clostridioforme 90A4 |
n.a. |
n.a. |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Clostridium clostridioforme 90A8 |
n.a. |
n.a. |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Clostridium clostridioforme 90B1 |
n.a. |
n.a. |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Clostridium clostridioforme CM201 |
n.a. |
n.a. |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Clostridium hathewayi 12489931 |
n.a. |
n.a. |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Clostridium stercorarium subsp stercorarium DSM 8532 |
n.a. |
n.a. |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Bacteroides vulgatus ATCC 8482 |
n.a. |
n.a. |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Eubacterium eligens ATCC 27750 |
n.a. |
n.a. |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Lactobacillus brevis ATCC 367 |
n.a. |
n.a. |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Lactobacillus brevis KB290 |
n.a. |
n.a. |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Lactobacillus brevis subsp gravesensis ATCC 27305 |
n.a. |
n.a. |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Lactobacillus buchneri NRRL B 30929 |
n.a. |
n.a. |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Lactobacillus coleohominis 101 4 CHN |
n.a. |
n.a. |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Lactobacillus parabrevis ATCC 53295 |
n.a. |
n.a. |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Lactobacillus paracasei 32G |
n.a. |
n.a. |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Lactobacillus rhamnosus ATCC 21052 |
n.a. |
n.a. |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Lactobacillus rhamnosus ATCC 8530 |
n.a. |
n.a. |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Lactobacillus rhamnosus GG ATCC 53103 |
n.a. |
n.a. |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Lactobacillus rhamnosus HN001 |
n.a. |
n.a. |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Lactobacillus rhamnosus Lc 705 |
n.a. |
n.a. |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Lactobacillus rhamnosus LMS2 1 |
n.a. |
n.a. |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Lactobacillus rhamnosus LRHMDP2 |
n.a. |
n.a. |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Lactobacillus rhamnosus LRHMDP3 |
n.a. |
n.a. |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Lactobacillus rhamnosus R0011 |
n.a. |
n.a. |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Lactobacillus suebicus DSM 5007 KCTC 3549 |
n.a. |
n.a. |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Lactobacillus zeae DSM 20178 KCTC 3804 |
n.a. |
n.a. |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Clostridium asparagiforme DSM 15981 |
n.a. |
n.a. |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Clostridium clostridioforme 90A6 |
n.a. |
n.a. |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Propionibacterium acnes KPA171202 |
n.a. |
n.a. |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Propionibacterium avidum 44067 |
n.a. |
n.a. |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Propionibacterium avidum ATCC 25577 |
n.a. |
n.a. |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Propionibacterium namnetense SK182B JCVI |
n.a. |
n.a. |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Streptococcus bovis ATCC 700338 |
n.a. |
n.a. |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Sulfolobus solfataricus P2 |
n.a. |
n.a. |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Lactobacillus buchneri CD034 |
n.a. |
n.a. |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Bacteroides clarus |
Bacteroides |
Bacteroidaceae |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
|
Bacteroides fragilis |
Bacteroides |
Bacteroidaceae |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
|
Bacteroides thetaiotaomicron |
Bacteroides |
Bacteroidaceae |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
|
Bacteroides xylanisolvens |
Bacteroides |
Bacteroidaceae |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
No |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
|
Bifidobacterium dentium |
Bifidobacterium |
Bifidobacteriaceae |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
No |
No |
No |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
|
Citrobacter youngae |
Citrobacter |
Enterobacteriaceae |
Yes |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
|
Clostridium butyricum |
Clostridium |
Clostridiaceae |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
|
Enterococcus faecalis |
Enterococcus |
Enterococcaceae |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
|
Enterococcus faecium |
Enterococcus |
Enterococcaceae |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
|
Escherichia albertii |
Escherichia |
Enterobacteriaceae |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
No |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
|
Escherichia coli |
Escherichia |
Enterobacteriaceae |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
|
Clostridium sp. |
Clostridium |
Clostridiaceae |
No |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
No |
No |
Yes |
Yes |
No |
No |
Yes |
|
Escherichia sp. |
Escherichia |
Enterobacteriaceae |
No |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
|
Brachyspira pilosicoli |
Brachyspira |
Brachyspiraceae |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
No |
No |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
No |
|
Faecalibacterium prausnitzii |
Faecalibacterium |
Ruminococcaceae |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
|
Clostridium perfringens |
Clostridium |
Clostridiaceae |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
|
Lactobacillus jensenii |
Lactobacillus |
Lactobacillaceae |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
No |
|
Lactobacillus gasseri |
Lactobacillus |
Lactobacillaceae |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
No |
No |
Yes |
Yes |
No |
No |
No |
|
Marvinbryantia formatexigens |
Marvinbryantia |
Lachnospiraceae |
No |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
|
Parabacteroides johnsonii |
Parabacteroides |
n.a. |
No |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
No |
No |
No |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
|
Ruminococcus flavefaciens |
Ruminococcus |
Ruminococcaceae |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
|
Salmonella enterica |
Salmonella |
Enterobacteriaceae |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
|
Staphylococcus epidermidis |
Staphylococcus |
Staphylococcaceae |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
No |
No |
No |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
|
Streptococcus dysgalactiae |
Streptococcus |
Streptococcaceae |
Yes |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
|
Roseburia intestinalis |
Roseburia |
Lachnospiraceae |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
No |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
|
Bifidobacterium longum |
Bifidobacterium |
Bifidobacteriaceae |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
|
[Clostridium] leptum |
n.a. |
Ruminococcaceae |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
|
Edwardsiella tarda |
Edwardsiella |
Hafniaceae |
No |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
No |
No |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
|
Parabacteroides distasonis |
Parabacteroides |
Porphyromonadaceae |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
|
Parabacteroides goldsteinii |
Parabacteroides |
Porphyromonadaceae |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
No |
No |
No |
Yes |
Yes |
No |
No |
|
Parabacteroides merdae |
Parabacteroides |
Porphyromonadaceae |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
No |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
|
Prevotella copri |
Prevotella |
Prevotellaceae |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
|
Bacteroides caccae |
Bacteroides |
Bacteroidaceae |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
|
Bacteroides cellulosilyticus |
Bacteroides |
Bacteroidaceae |
No |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
|
Roseburia hominis |
Roseburia |
Lachnospiraceae |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
|
Ruminococcus albus |
Ruminococcus |
Ruminococcaceae |
No |
No |
Yes |
No |
No |
Yes |
No |
Yes |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
|
Shigella flexneri |
Shigella |
Enterobacteriaceae |
No |
Yes |
Yes |
No |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
|
Streptococcus agalactiae |
Streptococcus |
Streptococcaceae |
No |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
No |
No |
Yes |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
|
Bacteroides finegoldii |
Bacteroides |
Bacteroidaceae |
No |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
|
Bacteroides intestinalis |
Bacteroides |
Bacteroidaceae |
No |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
|
Bacteroides ovatus |
Bacteroides |
Bacteroidaceae |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
|
Bacteroides uniformis |
Bacteroides |
Bacteroidaceae |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
|
Aeromicrobium massiliense |
Aeromicrobium |
Nocardioidaceae |
No |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
Yes |
Yes |
No |
|
Alistipes senegalensis |
Alistipes |
Rikenellaceae |
No |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
No |
Yes |
No |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
No |
|
Alistipes shahii |
Alistipes |
Rikenellaceae |
No |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
|
Anaerococcus tetradius |
Anaerococcus |
Peptoniphilaceae |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
|
Anaerotruncus sp. G3(2012) |
Anaerotruncus |
Oscillospiraceae |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
|
Bacteroides faecis |
Bacteroides |
Bacteroidaceae |
No |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
|
Bacteroides gallinarum |
Bacteroides |
Bacteroidaceae |
No |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
No |
Yes |
No |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
|
Bacteroides sp. |
Bacteroides |
Bacteroidaceae |
No |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
No |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
|
Bacteroides sp. D1 |
Bacteroides |
Bacteroidaceae |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
|
Bacteroides sp. D2 |
Bacteroides |
Bacteroidaceae |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
|
Bacteroides sp. D20 |
Bacteroides |
Bacteroidaceae |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
|
Bacteroides sp. D22 |
Bacteroides |
Bacteroidaceae |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
|
Capnocytophaga sp. oral taxon 329 |
Capnocytophaga |
Flavobacteriaceae |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
|
Clostridium colicanis |
Clostridium |
Clostridiaceae |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
|
Bacteroides oleiciplenus |
Bacteroides |
Bacteroidaceae |
No |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
|
Clostridium saccharoperbutylacetonicum |
Clostridium |
Clostridiaceae |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
|
Corynebacterium efficiens |
Corynebacterium |
Corynebacteriaceae |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
|
Corynebacterium glucuronolyticum |
Corynebacterium |
Corynebacteriaceae |
No |
Yes |
Yes |
No |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
|
Cutibacterium acnes |
Cutibacterium |
Propionibacteriaceae |
No |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
No |
Yes |
No |
No |
No |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
No |
|
Dysgonomonas mossii |
Dysgonomonas |
Dysgonomonadaceae |
No |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
No |
Yes |
No |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
|
Enterococcus cecorum |
Enterococcus |
Enterococcaceae |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
|
Escherichia sp. TW09308 |
Escherichia |
Enterobacteriaceae |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
|
[Eubacterium] siraeum |
[Eubacterium] |
Eubacteriaceae |
No |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
No |
No |
Yes |
Yes |
No |
No |
No |
|
Lachnospiraceae bacterium oral taxon 082 |
Lachnospiraceae |
n.a. |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Clostridium celatum |
Clostridium |
Clostridiaceae |
No |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
|
Paenibacillus daejeonensis |
Paenibacillus |
Paenibacillaceae |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
|
Paenibacillus sp. HW567 |
Paenibacillus |
Paenibacillaceae |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
|
Paenibacillus sp. JDR-2 |
Paenibacillus |
Paenibacillaceae |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
|
Paludibacter propionicigenes |
Paludibacter |
Paludibacteraceae |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
Yes |
Yes |
No |
|
Parabacteroides sp. ASF519 |
Parabacteroides |
Tannerellaceae |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
|
Parabacteroides sp. D13 |
Parabacteroides |
Tannerellaceae |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
|
Parabacteroides sp. D25 |
Parabacteroides |
Tannerellaceae |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
|
Clostridium sartagoforme |
Clostridium |
Clostridiaceae |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
|
Pediococcus acidilactici |
Pediococcus |
Lactobacillaceae |
No |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
No |
|
Prevotella bryantii |
Prevotella |
Prevotellaceae |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
|
Prevotella dentalis |
Prevotella |
Prevotellaceae |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
Yes |
Yes |
No |
No |
|
Collinsella tanakaei |
Collinsella |
Coriobacteriaceae |
No |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
No |
|
Prevotella ruminicola |
Prevotella |
Prevotellaceae |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
No |
|
Propionibacterium sp. 409-HC1 |
Propionibacterium |
Propionibacteriaceae |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Propionibacterium sp. |
Propionibacterium |
Propionibacteriaceae |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Propionibacterium sp. HGH0353 |
Propionibacterium |
Propionibacteriaceae |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Ruminococcus champanellensis |
Ruminococcus |
Oscillospiraceae |
No |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
|
Shigella dysenteriae |
Shigella |
Enterobacteriaceae |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
|
Shigella sonnei |
Shigella |
Enterobacteriaceae |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
|
Shuttleworthia satelles |
Shuttleworthia |
Lachnospiraceae |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
Yes |
Yes |
No |
|
Staphylococcus arlettae |
Staphylococcus |
Staphylococcaceae |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
|
Staphylococcus equorum |
Staphylococcus |
Staphylococcaceae |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
|
Staphylococcus haemolyticus |
Staphylococcus |
Staphylococcaceae |
No |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
No |
No |
Yes |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
|
Staphylococcus simulans |
Staphylococcus |
Staphylococcaceae |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
|
Staphylococcus warneri |
Staphylococcus |
Staphylococcaceae |
No |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
No |
No |
Yes |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
|
Staphylococcus xylosus |
Staphylococcus |
Staphylococcaceae |
No |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
|
Streptococcus equi |
Streptococcus |
Streptococcaceae |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
|
Streptococcus pasteurianus |
Streptococcus |
Streptococcaceae |
No |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
No |
Yes |
No |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
|
Streptococcus pneumoniae |
Streptococcus |
Streptococcaceae |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
|
Streptococcus thoraltensis |
Streptococcus |
Streptococcaceae |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
|
Streptococcus uberis |
Streptococcus |
Streptococcaceae |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
|
Tannerella sp. |
Tannerella |
Tannerellaceae |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
|
Paraprevotella clara |
Paraprevotella |
Prevotellaceae |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
Yes |
No |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
|
Paraprevotella xylaniphila |
Paraprevotella |
Prevotellaceae |
No |
Yes |
Yes |
No |
Yes |
No |
Yes |
Yes |
No |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
No |
|
Lachnospiraceae bacterium 2 1 58FAA |
n.a. |
Lachnospiraceae |
Yes |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
|
Lachnospiraceae bacterium 3 1 57FAA CT1 |
n.a. |
Lachnospiraceae |
Yes |
No |
Yes |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
No |
Yes |